Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata5P97489 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms