Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms