Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhodP97348 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhodP97348 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhodP97348 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhodP97348 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhodP97348 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhodP97348 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RhodP97348 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RhodP97348 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RhodP97348 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms