Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mesp1P97309 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms