Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfbiP82198 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfbiP82198 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfbiP82198 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfbiP82198 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfbiP82198 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TgfbiP82198 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms