Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx1P81068 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms