Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cct7P80313 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms