Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms