Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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