Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms