Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms