Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms