Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf6P70196 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms