Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms