Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga11P61622 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms