Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx1bP61264 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx1bP61264 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms