Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap25P60879 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms