Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ActbP60710 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ActbP60710 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ActbP60710 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ActbP60710 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms