Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrnp3P59055 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms