Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm2P58774 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms