Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P58686 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P58686 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P58686 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P58686 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P58686 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P58686 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P58686 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P58686 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P58686 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P58686 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
P58686 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P58686 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P58686 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P58686 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms