Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Paxbp1P58501 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms