Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms