Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms