Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms