Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gsc2P56916 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsc2P56916 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms