Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms