Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms