Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GemP55041 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GemP55041 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GemP55041 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms