Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms