Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms