Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms