Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms