Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms