Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psen1P49769 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms