Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms