Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc3P49135 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc3P49135 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms