Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb41P48193 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms