Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx2P48031 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms