Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms