Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgavP43406 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms