Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Mmp9P41245 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Mmp9P41245 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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