Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt4P40749 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt4P40749 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt4P40749 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt4P40749 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt4P40749 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt4P40749 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt4P40749 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt4P40749 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt4P40749 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt4P40749 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syt4P40749 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syt4P40749 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt4P40749 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms