Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd1P40201 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd1P40201 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd1P40201 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms