Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms