Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab20P35295 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms