Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Saa4P31532 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms