Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp1P29452 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms