Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms