Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprmP28828 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
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